Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta
Tämä wiki käsittelee biologisten näytteiden digitointia ja biologisen tiedon hallintaa.
Huomaa että julkaisu ja siihen tehdyt muokkaukset ja kommentit ovat käytettävissä Creative Commons Nimeä-Tarttuva 1.0 Suomi -lisenssillä.
Kokoelmien hallinta
Kladikirjojen digitointi
- Mallitietue n4-049a.xml(ensimmäinen versio)
Tutkimusaineistojen ja tiedonhallinnan käsikirja
- Miksi tiedonhallintaa ja jatkokäyttöä?
- Tiedonhallinnan suunnittelu
- Oikeudet aineistoon
- Aineiston kuvaaminen ja metadata
- Standardoidut sanastot ja ontologiat
- Lajinimet
- Paikkatieto
- Muuttujat
- Henkilöt ja organisaatiot
- Tiedostomuodot ja aineistojen hallinnan työkalut
- Kokoelmien hallinta ja digitointi
- Tutkimusaineistojen hallinta
- Pitkäaikaissäilytys
Käsikirja FMNH2008-skeman soveltamiseen
FMNH2008 on LTKM:n muunnos TDWG:n standardoimaan, kokoelmatiedon hallintaan ja vaihtamiseen soveltuvaan ABCD (Access to Biological Collections Data)-skemaan. FMNH2008 on muunnettu soveltumaan näytetietojen lisäksi paremmin myös havaintotiedon tallettamiseen. Muunnos mahdollistaa havainto-olosuhteiden ja paikan kuvaamisen yhdelle datasetille, eli havaintoerälle kerrallaan ja siten myös eri lajien dokumentoidut 0-havainnot. Kokonaisten aineistojen metadata kuvaillaan soveltuvin osin EML:n (Ecological Metadata Language) mukaisesti. Muuttujina käytetään mahdollisuuksien mukaan sandardoituja sanastoja, jollon käsitteiden välsisä suhteistä voidaan myhemmin kuvata ontologiana.
Alkuperäiset skemat ja niiden dokumentaatiot löytyvät:
- http://www.fmnh.helsinki.fi/schemas/fmnh2008/
- http://www.fmnh.helsinki.fi/schemas/fmnh2008/documentation.html
- ABCDWiki
- EML
Näytteiden digitointiopas
Wiki perustuu Mikko Heikkisen graduun "Tyyppinäytteiden digitointi", mutta sitä voi laajentaa tai kommentoida kuka tahansa. Oppaaseen pääsee myös osoitteesta http://www.biomi.org/biologia/digit
- Johdanto
- Työn tavoite
- Mitä tyyppinäytteet ovat?
- Aineisto ja menetelmät
- Valokuvaaminen
- Muut näytetietokannat ja -julkaisut
- Digitointi ja julkaiseminen
- Digitointi
- Julkaiseminen
- Tutkijoiden ja tutkimuslaitosten tarpeita
- Digitoinnin ja julkaisemisen sisältötasot
- Mitä tietoja julkaista?
- Miten tallentaa tiedot?
- Mitä tyyppinäytteitä digitoida?
- Näytetietojen digitointi käytännössä
- Virheet ja tarkistus
- Vanhojen versioiden säästäminen
- Yleistä tietojen tallentamisesta
- Digitoitavat näytetiedot
- Metatiedot
- Tunnisteet
- Nimet ja taksonomia
- Tyyppinäytteiden erikoistiedot
- Taksonomiset tuntomerkit
- Näytteiden valokuvaaminen
- Paikkatieto
- Muita näytetietoja
- Termejä
- Kirjallisuus
- Liitteet
Näytteiden digitointiopas: Julkaisutiedot
URN:NBN:fi-fe200802261106 (1. versio)
Pohjatyö: Mikko Heikkinen/biomi.org.
Tämä teos (koko wiki) on käytettävissä Creative Commons Nimeä-Tarttuva 1.0 Suomi -lisenssillä.
Tekijäksi nimeä Luonnontieteellinen keskusmuseo, tietohallintotiimi. (Mikko Heikkinen, Hanna Koivula, Tommi Koskinen, Tapani Lahti ym.)