Työkalu tunnisteiden generointiin tiedostoon

Englanninkielinen sivu: Generate ID's to Excel

Työkalu kehitettiin alunperin Luomuksen genomikokoelman tarpeisiin. Ongelmana oli, että kun genomikokelman datan tallentajat käyttävät Excel-tallennuspohjaa datan syöttämiseen, he joutuivat aina tarkastamaan Kotkasta onko jollain näytteellä jo olemassa preparaatteja ja mikä on seuraava vapaa prepataattitunniste (sample ID). Ratkaisuksi tehtiin tämä työkalu. Työkalun käyttö:

1. Täytä tavalliseen tapaan Kotkan Excel-tallennuspohja, muutoin ihan importia varten valmiiksi asti mutta jätä sarake MYGathering[0][MYUnit][0][MFSample][0][subject] tyhjäksi sampleID luomista varten.
2. Jos haluat generoida preparaateille Additional ID -tunnisteen jostakin sekvenssistä, täytä numerointisekvenssin ns. otsikko sarakkeeseen MYGathering[0][MYUnit][0][MFSample][0][MFAdditionalIDs][0], mutta jätä numero tyhjäksi (esim. "Luomus vertebrate tissue number:").
3. Mene työkaluun Kotkassa: Tools → Generate IDs to Excel. Selaa tiedostoon ja klikkaa autofill. Tässä voi kestää hetki, erityisesti jos tiedosto on suuri.
4. Ulos putkahtaa Excel-tiedosto, jonka pitäisi olla pysynyt muuten samanlaisena kuin se oli ennen työkaluun syöttämistä, mutta siihen on generoitu SampleID:t ja mahdolliset AdditionalID:t.