Last modified by Xwiki VePa on 2024/02/07 07:37
Show last authors
1 [[image:attach:300kansietiketit_GX33 copy.jpg]]
2 Tämä wiki käsittelee biologisten näytteiden digitointia ja biologisen tiedon hallintaa.
3
4 Huomaa että julkaisu ja siihen tehdyt muokkaukset ja kommentit ovat käytettävissä [[Creative Commons Nimeä-Tarttuva 1.0 Suomi>>url:http://creativecommons.org/licenses/by-sa/1.0/fi/||shape="rect"]] -lisenssillä.
5
6 == Kokoelmien hallinta ==
7
8 * [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Kokoelmienhallinta.WebHome]]
9
10 == Kladikirjojen digitointi ==
11
12 1. Mallitietue [[n4-049a.xml>>url:https://wiki.helsinki.fi/display/digit/n4-049a.xml||shape="rect"]](ensimmäinen versio)
13
14 == Tutkimusaineistojen ja tiedonhallinnan käsikirja ==
15
16 1. [[Miksi tiedonhallintaa ja jatkokäyttöä?>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Tutkimusaineistojen ja tiedonhallinnan käsikirja.Miksi tiedonhallintaa ja uusiokäyttöä?.WebHome]]
17 1. [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Tutkimusaineistojen ja tiedonhallinnan käsikirja.Tiedonhallinnan suunnittelu.WebHome]]
18 1. [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Tutkimusaineistojen ja tiedonhallinnan käsikirja.Oikeudet aineistoon.WebHome]]
19 1. [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Tutkimusaineistojen ja tiedonhallinnan käsikirja.Aineiston kuvaaminen ja metadata.WebHome]]
20 1. Standardoidut sanastot ja ontologiat
21 11. Lajinimet
22 11. Paikkatieto
23 11. Muuttujat
24 11. Henkilöt ja organisaatiot
25 1. Tiedostomuodot ja aineistojen hallinnan työkalut
26 1. Kokoelmien hallinta ja digitointi
27 1. Tutkimusaineistojen hallinta
28 1. Pitkäaikaissäilytys
29
30 == Käsikirja FMNH2008-skeman soveltamiseen ==
31
32 FMNH2008 on LTKM:n muunnos TDWG:n standardoimaan, kokoelmatiedon hallintaan ja vaihtamiseen soveltuvaan ABCD (Access to Biological Collections Data)-skemaan. FMNH2008 on muunnettu soveltumaan  näytetietojen lisäksi paremmin myös havaintotiedon tallettamiseen. Muunnos mahdollistaa havainto-olosuhteiden ja paikan kuvaamisen yhdelle datasetille, eli havaintoerälle kerrallaan ja siten myös eri lajien dokumentoidut 0-havainnot. Kokonaisten aineistojen metadata kuvaillaan soveltuvin osin EML:n (Ecological Metadata Language) mukaisesti. Muuttujina käytetään mahdollisuuksien mukaan sandardoituja sanastoja, jollon käsitteiden välsisä suhteistä voidaan myhemmin kuvata ontologiana.
33
34 * [[FMNH2008 käsikirja>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.FMNH2008 käsikirja.WebHome]]
35
36 Alkuperäiset skemat ja niiden dokumentaatiot löytyvät:
37
38 * [[http:~~/~~/www.fmnh.helsinki.fi/schemas/fmnh2008/>>url:http://www.fmnh.helsinki.fi/schemas/fmnh2008/||shape="rect"]]
39 * [[http:~~/~~/www.fmnh.helsinki.fi/schemas/fmnh2008/documentation.html>>url:http://www.fmnh.helsinki.fi/schemas/fmnh2008/documentation.html||shape="rect"]]
40 * [[ABCDWiki>>url:http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/ABCD/WebHome||shape="rect"]]
41 * [[EML>>url:http://knb.ecoinformatics.org/software/eml/eml-2.1.0/||shape="rect"]]
42
43 == Näytteiden digitointiopas ==
44
45 Wiki perustuu Mikko Heikkisen graduun "Tyyppinäytteiden digitointi", mutta **sitä voi laajentaa tai kommentoida kuka tahansa**. Oppaaseen pääsee myös osoitteesta [[http:~~/~~/www.biomi.org/biologia/digit>>url:http://www.biomi.org/biologia/digit||shape="rect"]]
46
47 1. [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Johdanto.WebHome]]
48 11. Työn tavoite
49 11. Mitä tyyppinäytteet ovat?
50 1. [[Aineisto ja menetelmät>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Aineisto ja menetelmät.WebHome]]
51 11. Valokuvaaminen
52 11. Muut näytetietokannat ja -julkaisut
53 1. [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Digitointi ja julkaiseminen.WebHome]]
54 11. Digitointi
55 11. Julkaiseminen
56 11. Tutkijoiden ja tutkimuslaitosten tarpeita
57 11. Digitoinnin ja julkaisemisen sisältötasot
58 11. Mitä tietoja julkaista?
59 11. Miten tallentaa tiedot?
60 11. Mitä tyyppinäytteitä digitoida?
61 1. [[Näytetietojen digitointi käytännössä>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Näytetietojen digitointi käytännössä.WebHome]]
62 11. Virheet ja tarkistus
63 11. Vanhojen versioiden säästäminen
64 11. Yleistä tietojen tallentamisesta
65 1. [[Digitoitavat näytetiedot>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Digitoitavat näytetiedot.WebHome]]
66 11. Metatiedot
67 11. Tunnisteet
68 11. Nimet ja taksonomia
69 11. Tyyppinäytteiden erikoistiedot
70 11. Taksonomiset tuntomerkit
71 11. Näytteiden valokuvaaminen
72 11. Paikkatieto
73 11. Muita näytetietoja
74 1. [[Termejä>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Termejä.WebHome]]
75 1. [[doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Kirjallisuus.WebHome]]
76 1. Liitteet
77 11. [[Luettelo näytetiedoista (liite 1)>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Luettelo näytetiedoista (liite 1).WebHome]]
78 11. [[Digitoitujen tyyppinäytteiden etsiminen Googlen avulla (liite 2)>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Digitoitujen tyyppinäytteiden etsiminen Googlen avulla (liite 2).WebHome]]
79 11. [[Luonnos tyyppinäytteiden digitoinnissa kerättäviksi tiedoiksi (liite 3)>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Luonnos tyyppinäytteiden digitoinnissa kerättäviksi tiedoiksi (liite 3).WebHome]]
80 11. [[Paikkatietoa mannerheimin kokoelman näytteistä (liite 4)>>doc:digit.Archived content.Näytteiden digitointi ja biologisen tiedon hallinta.Näytteiden digitointiopas.Paikkatietoa mannerheimin kokoelman näytteistä (liite 4).WebHome]]
81 11. [[Excel-pohja tallennukseen>>attach:tyyppinaytepohja.xls]]
82
83 ===== Näytteiden digitointiopas: Julkaisutiedot =====
84
85 URN:NBN:fi-fe200802261106 (1. versio)
86
87 Pohjatyö: [[Mikko Heikkinen/biomi.org>>url:http://www.biomi.org||shape="rect"]].
88
89 ----
90
91 [[image:attach:cc-icon.jpg]]
92
93 Tämä teos (koko wiki) on käytettävissä [[Creative Commons Nimeä-Tarttuva 1.0 Suomi>>url:http://creativecommons.org/licenses/by-sa/1.0/fi/||shape="rect"]] -lisenssillä.
94 **Tekijäksi nimeä Luonnontieteellinen keskusmuseo, tietohallintotiimi.** (//Mikko Heikkinen, Hanna Koivula, Tommi Koskinen, Tapani Lahti// //ym.)//