Taksonomian hallinta

Englanninkielinen sivu: Handling taxonomy

Taksonomian hallinta on pääosin ulkoistettu erilliseen Lajitietokeskuksen taksonitietokantaan. Se huolehtii nimilistoista, taksonomisesta hierarkiasta, synonyymeistä yms.

Kytkentä taksonitietokantaan (tilanne 10/2021)

Tätä kirjoitettaessa Kotka on kytketty taksonitietokantaan seuraavilla tavoilla:

Datan syöttö

Kun WWW-tallennuslomakkeelle alkaa kirjoittamaan taksonin nimeä, ehdottaa se täsmääviä taksonien nimiä pudotusvalikkona (kuva). Nimet haetaan taksonitietokannan master-lajilistasta. Kun jokin näistä valitaan, täytetään taksoni, taksonominen taso ja auktori automaattisesti. Excel-tallennuspohjaan nämä täytyy kirjata käsin.

Jos taksonin nimen, tason ja auktorin kirjoittaa kokonaan itse, lomake tarkistaa löytyykö löytyykö vastaava yhdistelmä master-lajilistasta, ja varoittaa jos ei sellaista löydy (kuva). Käyttäjä saa kuitenkin tallentaa mitä vain nimiä, myös nimiä, joita ei löydy.

Näytteen tietojen katselunäkymä

Jos nimi löytyy master-lajilistasta, hakee Kotka näytteen tietojen yhteyteen taksonin hyväksytyn nimen. Hyväksytty nimi näytetään se näytteen view-sivulla. Hyväksytty nimi voidaan myös tulostaa etiketille.

Näytehaku

Näytehaussa, hakukenttä "Taxa" sisältää taksonomisen hiearkian tallennetusta taksonista ylöspäin (heimo, lahko jne. aina Biotaan asti), jos tallennettu taksoni löytyy taksonitietokannasta.

Näytteitä voidaan hakea hyväksytyn nimen, ylemmän taksonomisen hierarkian, heimon ja synonyyminimien (kentät AcceptedTaxon, Taxa, Family and Synonyms) avulla Kotkan hakulomakkeella. Synonyymihaun kanssa on ongelmia (tilanne 10/2021). Näytteitä voi hakea myös niiden taksonomiseen tietokantaan määritellyn uhanalaisuusluokan avulla (hakukenttä endangeredStatus). Jos näyte on määritetty nimellä, jota ei löydy master-lajilistasta, löytyy se hakulomakkeella vain hakemalla tällä täsmällisellä nimellä (sekä Kotkassa että laji.fi:ssä). Kun taksonitietokantaan lisätään uusia nimistöjä, päivittyvät niiden tiedot Kotkan hakutietokantaan seuraavana yönä.

Esimerkki

Näyte http://id.luomus.fi/KS.1 on tallennettu Kotkaan nimellä "Psetta maxima" ja auktorina "(Linnaeus)". Taksonitietokannassa tämä on synonyymi nimelle  "Scophthalmus maximus (Linnaeus, 1758)". Molemmat nimet näkyvät näytteen tietojen katselussa Kotkassa.

Taksonomista hierarkiaa voidaan katsella näytehaun tulostaulukossa Taxa-kentässä.

Puutarhojen kasvikannat

Puutarhojen kasvikantojen tietojen katselusivulla näytetään taksonin nimi sivun ylälaidassa, ja se toimii linkkinä taksonin lajikortille, jos taksoni löytyy tietokkannasta.